Nanoporen-basierte elektrisch-optische Proteindiagnostik (nEOdiag)

Schwerpunktthema: Life Science Technologies
Art der Förderung: Projektförderprogramme
Programm: CZS Durchbrüche
Geförderte Institution:
  • Albert-Ludwigs-Universität Freiburg

Die Sequenzierung von Proteinen verspricht Forschung und Medizin signifikant voranzubringen, ist aber teuer und zeitaufwendig. Eine gleichzeitige Messung von elektrischen Signalen und Fluoreszenz soll eine schnelle, kostengünstige Proteinsequenzierung ermöglichen.

Ziele

Proteine sind gefaltete Kettenmoleküle aus 21 unterschiedlichen Aminosäuren, deren jeweils charakteristische Abfolge ihre Form und Funktion maßgeblich bestimmt. Die Analyse dieser Sequenzen ist daher in Forschung und Medizin von grundlegender Bedeutung. Allerdings ist die Proteinsequenzierung deutlich teurer und zeitaufwändiger als die der DNA, die aus nur 4 Bausteinen besteht. Das Projekt nEOdiag addressiert diese Herausforderung, indem Proteinsequenzen mit Hilfe sog. Nanoporen gleichzeitig elektrisch und über Fluoreszenz ausgelesen werden.  
Bei Ein- und Austritt der Aminosäureketten in eine solche von Ionen durchströmte Pore von molekularen Abmessungen wird elektrisch ein Stromsignal gemessen. Zusätzlich wird die innere Porenwand mit fluoreszierenden Molekülen versehen, deren Lichtsignal durch die mit ihnen auf engstem Raum direkt wechselwirkenden Aminosäuren charakteristisch verändert wird. Die Korrelation beider Signale soll erstmals die Proteinsequenzierung mit Nanoporen ermöglichen. Die praktische Umsetzung dieser Idee erfordert mikroelektronische Innovationen zur hochparallelen, multimodalen Datenerfassung, KI-basierte Algorithmen zur sensorfusionsbasierten Erkennung von Proteinsequenzen sowie mikrosystemtechnische Neuerungen bei Miniaturisierung, Parallelisierung und Integration. 

Beteiligte Personen:

Dr. Phil-Alan Gärtig

Programm-Manager

Telefon: +49 (0)711 - 162213 - 10

E-Mail: phil-alan.gaertig@carl-zeiss-stiftung.de

Prof. Dr. Jan C. Behrends

Albert-Ludwigs-Universität Freiburg

Detailinformation:

Schwerpunktthema: Life Science Technologies
Programm: CZS Durchbrüche
Art der Förderung: Projektförder­programme
Zielgruppe: Professor:innen
Fördersumme: 4.966.000 €
Zeitraum: Oktober 2023 - September 2029

Geförderte Institution:

Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg